«Люди в чёрном 2» продолжает историю о приключениях агентов Кея и Джея, работающих в секретной организации, занимающейся защитой Земли от инопланетных угроз. Прошло четыре года с момента их предыдущих похождений. Агент Кей ведёт спокойную жизнь, в то время как агент Джей продолжает свою работу. В ходе расследования обычного дела Джей сталкивается с заговором, организованным Серлиной, инопланетным существом, скрывающимся под личиной модели.
